La société nippone avait déjà prévenu que la technologie 3D utilisée risquait de provoquer des problèmes chez les enfants et ceux qui ont une vue fragile. Elle a reprécisé certains points quant à l'utilisation prolongée : une pause 3D est conseillée toutes les 30 minutes pour les yeux les plus fragiles.
Rien de bien méchant étant donné que la console peut gérer le niveau de 3D facilement grâce à une molette contrôlant la profondeur de la 3D et cela n'empêchera pas à l'utilisateur de continuer à jouer. Les symptômes sont un mal de tête et une fatigue accrue des yeux. Cela est amplifié par le fait que la console est proche de l'utilisateur.